本分局 置有分局長1名、副分局長2名、內設行政、督察、防治、保安民防、交通等5個組、秘書、會計、人事等3個室、勤務指揮中心、偵查隊、警備隊等單位下轄：南門、博愛、海安、民權、中正、長樂等6個派出所及交通分隊。
行政組
- 聯絡電話：06-2134480
防治組
- 聯絡電話：06-2134477
人事室
- 聯絡電話：06-2134419
督察組
- 聯絡電話：06-2134479
保安民防組
- 聯絡電話：06-2134483
偵查隊
- 聯絡電話：06-2134494
交通組
- 聯絡電話：06-2131576
勤務指揮中心
- 聯絡電話：06-2139070
秘書室
- 聯絡電話：06-2134499
會計室
- 聯絡電話：06-2145260
警備隊
- 地址：臺南市中西區南寧街144號
- 聯絡電話：06-2149238
交通分隊
- 地址：臺南市中西區民生路2段271號
- 聯絡電話：06-2229226
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